Nanofiltrasyon son zamanlarda kullanılmaya başlanmıştır. Dolayısıyla moleküler ağırlık sınırı ultrafiltrasyon ile ters ozmoz arasındaki bir membran ayırma yöntemidir.
Genellikle bakterilerin, virüslerin, organik kalıntıların ve sertliğin uzaklaştırılmasında kullanılmaktadır. Diğer alternatiflerin uygun olmadığı durumlarda nanofiltrasyon demineralizasyon, renk giderimi, COD giderimi, atık su geri kazanım yerine kullanılmaktadır.
Ürünler